苄索氯铵，易溶于水形成泡沫状肥皂水样溶液，溶于乙醇、丙酮、氯仿。用于杀菌消毒剂，苄索氯铵是新型的防腐剂，具有较好的表面活性，广泛用于日化，医药等领域做防腐、杀菌剂。苄索氯铵是一种新型的季铵盐类抗菌剂，在日用化学品和化妆品行业有广泛的应用。此外，作为杀菌抗菌剂在医药卫生领域也有重要的应用，比如作为滴眼液的抑菌组分或者作为注射液的抑菌成分在西方国家一直有广泛的应用。在肝素钠产品的生产中，苄索氯铵是必不可少的关键中间体。具有杀菌和祛臭的作用.结晶体极易溶于水和其它溶剂,能配制粉状或液状的家庭或工业杀菌剂消毒剂.还能作为防腐剂或抗菌剂用于局部施用的兽医和专卖药品,按照使用指南应用，对环境表面没有腐蚀性。